De la señal a una interpretación defendible.

METODOLOGÍA · REVISIÓN DEL 9 DE OCTUBRE DE 2026

Una señal adquirida, una distribución invertida y una masa molecular derivada no son lo mismo. DiffAtOnce conecta esas capas y conserva las decisiones que permiten pasar de una a otra. Esta guía desarrolla el fundamento físico, el tratamiento numérico y los controles prácticos de Prime y ResinAtOnce, sin presentar una simulación, un buen ajuste o una prueba de software como validación experimental.

La ruta científica: preparación y adquisición → señal firmada y codificación revisada → inversión y diagnóstico → correcciones documentadas → distribución y magnitudes derivadas → revisión explícita → proyecto e informe reproducibles. Si falta información, el estado permanece desconocido o pendiente de revisión; no se inventa un resultado.

01 · Un núcleo compartido, dos recorridos científicos

DiffAtOnce Prime es el estudio de difusión de propósito general: selección de señales, DOSY, MwOSY, análisis local, comparación de motores y recorridos específicos de investigación. ResinAtOnce organiza preparaciones, rampas y lotes de resinas y polímeros, distingue señales de resina, diluyente reactivo, aditivo, impureza y disolvente, y conecta los resultados con el informe. Comparten contratos y módulos científicos; no se supone que sus interfaces ni todos sus recorridos sean idénticos.

El núcleo calcula; la interfaz permite revisar y aplicar. Las opciones avanzadas se despliegan a petición del usuario, pero cerrarlas no cambia parámetros personalizados o importados. Restablecer valores estándar es una decisión explícita para el siguiente cálculo, no una modificación silenciosa del resultado guardado. Un perfil estándar es un punto de partida, no una calibración universal de todas las muestras.

DiffAtOnce Legacy, el laboratorio online, Academy y las herramientas TopSpin tienen documentación propia. La disponibilidad de una función en uno de esos productos no demuestra su presencia en los demás. Consulte la guía de Prime, la guía de ResinAtOnce y los casos de uso narrados para localizar los controles de su versión.

02 · Qué mide la difusión por RMN

El movimiento traslacional durante un intervalo de codificación produce una distribución de fases. Para difusión libre gaussiana, un único coeficiente D, codificación equilibrada y ausencia de otros efectos no modelados, la atenuación ideal sigue la ecuación de Stejskal–Tanner:

\[I(b)=I_0\exp(-bD).\]

D tiene unidades m²/s y b, s/m²; el producto bD es adimensional. Para el par rectangular PGSE ideal, con duración δ, separación Δ entre comienzos y gradiente g:

\[b=\gamma^2g^2\delta^2(\Delta-\delta/3).\]

Esta expresión no se copia sin más a trenes bipolares, rampas, gradientes conformados, codificación espacial o secuencias con distintos signos efectivos. Si γ se expresa en rad·s⁻¹·T⁻¹, debe usarse esa convención en todo el cálculo. La expresión general en una dirección utiliza el gradiente efectivo, incluidos los cambios de signo impuestos por RF:

\[q(t)=\gamma\int_0^t g_{\mathrm{eff}}(u)\,du,\qquad b=\int_0^{T_E}q(t)^2\,dt.\]

En sistemas anisótropos o restringidos, una descripción escalar puede ser insuficiente. Relajación, intercambio, flujo, geometría y evolución de la muestra pueden modificar la señal. La ecuación elegida debe describir el experimento real, no sólo su aspecto. Stejskal y Tanner, 1965, fundamentan la codificación por gradientes.

03 · Diseñar una rampa que contenga información

La rampa debe observar tanto la parte inicial del decaimiento como una atenuación apreciable por encima del ruido. Si todos los valores bD son muy pequeños, una señal casi constante contiene poca información sobre D; si casi toda la señal desaparece en los primeros puntos, tampoco se recupera una distribución fiable. Aumentar bins no añade observaciones.

• Defina el intervalo D esperado, el tiempo disponible, la secuencia, los límites de gradiente y la relación señal/ruido necesaria. Compruebe que δ, Δ, tiempos de eco y formas son físicamente realizables.
• Conserve puntos de bajo b, puntos informativos en el decaimiento y, cuando el presupuesto lo permita, réplicas que permitan estimar ruido y deriva.
• Controle temperatura, estabilización, composición, concentración, altura de muestra, tubo y condiciones de relajación. Un experimento repetido no equivale a una preparación independiente.
• Registre duración y orden. Un orden permutado reproducible puede ayudar a distinguir deriva temporal de dependencia con b, pero no vuelve estacionaria una reacción.

El planificador propone diseños y simulaciones; no programa el espectrómetro ni verifica sus protecciones. Comparar diseños exige igual presupuesto de adquisición y límites de gradiente, eco y carga térmica, no sólo igual número de puntos. El trabajo p-DOSY, 2015, trata el problema del orden en muestras cambiantes.

04 · La sonda detectada no es una calibración de gradiente

PROBHD, número de serie, instrumento, núcleo y evidencia compatible sirven para proponer una sonda. Una familia o un nombre parecido no autoriza a sustituir su calibración. Se deben conservar la forma, los tiempos y el modelo temporal adquiridos. Porcentaje de gradiente y amplitud física son magnitudes diferentes.

La calibración puede proceder de un perfil experimental documentado, de valores b revisados, de Gmax calibrado o de un soluto de referencia bajo condiciones conocidas. Debe registrar unidades, secuencia, fecha, incertidumbre, instrumento y fuente. Una calibración con un soluto y una corrección interna posterior con el mismo soluto requieren comprobar que no se contabiliza dos veces la misma información.

Protocolo TBO conservado: la calibración compartida TBO_HDO_20260904 utiliza pendiente HDO 1,58627, Δ = 50 ms, δ = 1,20 ms y SMSQ10.100. No se sustituye por el gradiente nominal de 5,35 G/mm. La comparación literal Dref = 1,902 corresponde a 298,15 K, no a toda la rampa HDO real. Estos valores documentan ese protocolo; no son una receta transferible a cualquier sonda.

Un perfil descargado o un hash correcto acreditan integridad y procedencia declarada, no la validez física del gradiente. Aplicar una calibración distinta requiere revisión y una nueva revisión de cálculo.

05 · De los originales a una matriz de observaciones

En el recorrido DOSY convencional se leen espectros procesados compatibles y sus metadatos. Prime dispone además de rutas específicas de FID Bruker complejo y SER ultrafast; no se presentan como un importador universal de cualquier secuencia. Los lectores Bruker y Spinsolve del núcleo compartido requieren contratos y metadatos compatibles con el recorrido seleccionado.

Antes de invertir se revisan title, núcleo, disolvente, TE, secuencia, gradientes, tiempos, RG, NS, orientación del eje, fase, línea base y procesado. Apodización, recorte, interpolación, FFT y corrección de retardo tienen que quedar documentados. No se normaliza cada espectro a su propio máximo: se destruiría parte de la atenuación que se desea medir.

La matriz \(Y_{ij}\) relaciona adquisición i con región o bin espectral j. Se conserva la señal firmada en las rutas que la admiten; un valor negativo por ruido no se transforma en cero para fabricar una señal positiva. La magnitud de una señal compleja cambia el modelo de ruido y no es intercambiable sin revisión con la parte real correctamente faseada.

Los originales se leen sin modificaciones. Una adaptación, una copia alineada o un procesado diferente debe conservar el linaje respecto a su entrada, no reemplazarla.

06 · Picos estrechos, anchos, extracción local y alineamiento

Un doble clic sobre el espectro superior de Prime marca el máximo medido del entorno y abre su atenuación. La misma región se extrae en toda la rampa; no se persigue un máximo distinto en cada adquisición. Para comparar exactamente con el mapa, hay que igualar bin, promedio ppm, adquisiciones, método, rejilla y factores. Una banda global no equivale a una señal local.

La anchura ayuda a describir una señal, pero no identifica por sí sola un polímero o una macromolécula. Solapamiento, intercambio, acoplamientos, resolución, relajación y procesado también ensanchan picos. La selección de regiones debe hacerse por ppm y estructura de cada muestra: los índices de otra resina no son transferibles.

Si existe deriva, el diagnóstico compara desplazamiento, forma y área a lo largo de la rampa. iCOshift-Prime es una variante propia modificada, no una reproducción completa de iCOshift MATLAB 3.0. La aplicación del alineamiento requiere selección y justificación explícitas, crea una copia y conserva la anterior. Un caso no resuelto no demuestra ausencia de deriva. Cambios de proporción en solapamientos pueden parecer desplazamientos.

Alinear no corrige convección, fase, b incorrecto ni señal extinguida. Las rutas espaciales SPEN/ultrafast necesitan su reconstrucción específica. Véase el método iCOshift original y la ayuda de la variante instalada.

07 · Ruido, promedios y separación entre entrenamiento y evaluación

El modelo directo utiliza las coordenadas medidas. Para un conjunto de coeficientes D y adquisiciones b, el kernel básico es \(K_{ik}=\exp(-b_iD_k)\). Referencias y normalización térmica se aplican posteriormente a las magnitudes derivadas, no cambiando silenciosamente el operador medido.

Al agrupar adquisiciones mediante un operador H, la observación, el operador y la covarianza deben viajar juntos:

\[Y'=HY,\qquad K'=HK,\qquad \Sigma'=H\Sigma H^{\mathsf T}.\]

En general, el promedio de \(\exp(-b_iD)\) no es \(\exp(-\bar bD)\). Sólo con b idénticos u otra justificación explícita puede reducirse el operador sin cambiar su significado. El ruido de una media tampoco es automáticamente el ruido individual dividido por la raíz del número de puntos si hay correlación o tamaños de grupo distintos.

Normalizar por un I₀ compartido introduce correlación entre cocientes. Se distinguen ruido individual, de medias, heterogéneo y compartido. Un residuo pequeño no proporciona por sí solo una sigma independiente. Sin un modelo de ruido adecuado, la compatibilidad permanece desconocida.

La partición reservada se fija antes de construir máscaras, escalas, promedios dependientes de la señal o seleccionar regularización/rango. Réplicas de una preparación deben permanecer en el mismo grupo. Construir una máscara con TEST y después llamarlo validación independiente contamina la evaluación.

08 · Dos ajustes diferentes: intensidad y ln(I/I₀)

Un ajuste monoexponencial en intensidad minimiza discrepancias sobre I; una recta en el logaritmo minimiza otro objetivo y cambia la estructura de errores. Ambos pueden ser útiles como diagnósticos, pero no tienen por qué producir exactamente la misma D.

\[\ln(I_i/I_0)=c-D(b_i-b_0).\]

El panel lineal utiliza el punto positivo de menor b disponible como referencia y un intercepto libre. Presenta pendiente, intercepto, R², D medida y corregida y error OLS condicionado. NaN/Inf, b inválido o I ≤ 0 no son admisibles para el logaritmo; se registran sus motivos sin borrar esos datos de la inversión original.

La selección automática exploratoria para mejorar R² conserva por defecto al menos seis puntos y el 80 % del intervalo b, retirando como máximo el 20 % de puntos válidos. También permite selección manual y restaurar todos los válidos. Los excluidos deben seguir visibles. Un R² mayor tras quitar puntos puede sesgar D; no demuestra ausencia de convección, monodispersidad ni mayor exactitud. Esa máscara no se transfiere automáticamente a la inversión.

09 · Invertir una atenuación no es identificar una mezcla única

Para una distribución continua, la señal ideal es una transformada de Laplace. Una discretización por pesos integrados da:

\[I(b)=\int_0^{\infty}e^{-bD}\,d\mu(D),\qquad \widehat Y=KX.\]

La inversión es mal condicionada: distribuciones muy distintas pueden explicar observaciones cercanas dentro del ruido. La rejilla, el soporte, la regularización y las restricciones forman parte del resultado. Una curva suave no es necesariamente más verdadera, y un mínimo muy estrecho puede ser un artefacto de resolución.

El laboratorio permite comparaciones controladas sin cambiar automáticamente el motor de producción. RAI-S, DOME-S, SILT y otros métodos tienen sus contratos propios; compartir un selector no convierte sus hipótesis en equivalentes. Diffusion-Inversion local es una biblioteca C# incluida; una conexión HTTP o un ejecutable externo son interfaces diferentes, con versión, parámetros, unidades y revisión de respuesta.

10 · TRAIn-MF signed-v2.2: información compartida, estados separados

TRAIn-MF explota estructura entre frecuencias en vez de ajustar cada columna como si no tuviera relación con las demás. En una representación factorizada, \(X=SA\) y \(Y\approx KSA\). S describe perfiles de difusión; A, contribuciones espectrales bajo las convenciones del protocolo. Ni sus amplitudes ni su rango son automáticamente concentraciones o número de especies.

La integración signed-v2.2 conserva señal firmada, modelo nulo, selección reservada, aislamiento de entrenamiento, sigma independiente cuando existe, factores X/S/A y rangos nominal y activo. El rango seleccionado es predictivo, no una identificación química. Con ausencia de señal respaldada, el modelo nulo no inventa bandas, D, Rh o masas.

Se mantienen legacy-v1, signed-v2 y MF-AUTO para compatibilidad. MF-NNLS256 sigue siendo otro método. Un archivo antiguo no se convierte silenciosamente a signed-v2.2 al abrirse. La referencia MATLAB y el port C# se comparan mediante predicciones y descriptores con tolerancias, no exigiendo identidad arbitraria de factores intercambiables o reescalables.

La procedencia de signed-v2.2 está vinculada a train-dosy-public, commit 2f85657b50b752ca6ab3c122026b11288651fe8d. Las adaptaciones y el puente DiffAtOnce se identifican como propios. Ejecución, convergencia, compatibilidad con ruido e identificabilidad se registran por separado; requires_review no se oculta para obtener un mapa más atractivo.

11 · DOSY, campo gaussiano 2D y lóbulos laterales

El eje horizontal conserva desplazamiento químico; el vertical representa D o masa aparente. Original, Modelo y Residuo son representaciones distintas. La reconstrucción espacial mediante un diccionario de gaussianas multiescala describe la vista 2D y conserva la señal no ajustada. Sus átomos no son moléculas.

La proyección lateral integra contribuciones sobre ppm. Muchas señales espectrales pueden compartir un lóbulo de difusión. Por ello el número de átomos 2D no es el número de componentes laterales. El protocolo lateral-modes-v1 detecta lóbulos por prominencia y soporte local y ajusta la proyección activa sin suavizar en log₁₀(D) o log₁₀(M).

Si se observan un lóbulo grande y dos pequeños respaldados, el objetivo es describir esos tres, no dibujar una gaussiana por cada átomo espacial ni forzar una curva ancha que atraviese valles. El límite estándar de diez es un máximo configurable, no diez obligatorios. Se comparan total, suma ajustada, componentes, residuo firmado y señal positiva no asignada en una escala común.

Residual es un diagnóstico firmado, no una mezcla positiva para contar especies. El protocolo histórico dictionary-marginal-v1 permanece distinto. Recalcular componentes laterales no reinvierte, no modifica D ni vuelve a aplicar referencias o temperatura; conservar la nueva descomposición requiere revisión explícita. Anchura y área visual añadida no son dispersidad física ni concentración.

12 · Referencias internas, temperatura y viscosidad: factores visibles

El usuario puede obtener D sin referencia interna, siempre con b y condiciones revisadas y con esa ausencia indicada. Detectar una señal candidata no confirma qué patrón se añadió. TTMS, TMS, TSP y siliconas no son intercambiables por coincidir cerca de 0 ppm. Se revisan identidad, región, solapamiento, atenuación y Rh o D de referencia con fuente.

Para un patrón confirmado:

\[\begin{aligned}f_{\rm ref}&=\frac{D_{{\rm ref},\rm expected}(T)}{D_{{\rm ref},\rm measured}},\\D_{x,\rm final}&=f_{\rm ref}f_TD_{x,\rm measured}.\end{aligned}\]

El subíndice ref identifica el patrón y x, el analito: el cociente del patrón calibra el eje completo, no compara la D esperada del patrón con la D medida de cada analito.

Se puede elegir un patrón primario con controles o un consenso de factores compatibles; no se corrige cada analito con un factor distinto sólo para igualar valores deseados. La implementación de ResinAtOnce bloquea el consenso con desacuerdos superiores al criterio documentado del 10 %. Un control discordante requiere investigación, no exclusión automática para mejorar el resultado.

La normalización empírica lineal usa \(f_T=T_{\rm out}/T_{\rm acq}\), temperatura de salida dividida por temperatura adquirida. No equivale a medir la viscosidad ni a corregir convección. Para un modelo Stokes–Einstein con viscosidad dependiente de T, una transferencia ideal entre dos condiciones depende de T/η; esa ley debe seleccionarse y documentarse, no añadirse a un resultado que ya la incluye.

Resultado principal KK2: se aplica conjuntamente fTTMS = DTTMS esperado(T) / DTTMS medido y fT = 293/T. Se conservan fTTMS, fT y su producto por bloque; se aplica una sola vez al eje completo y se recalculan Rh, masas y momentos. No se usa applyReferenceSummary ni se reescala a tablas anteriores.

Prime permite correlaciones documentadas de viscosidad del disolvente o valores manuales; una viscosidad de disolvente puro/no deuterado es una aproximación para una mezcla. El recorrido nativo histórico de ResinAtOnce utiliza η de referencia fija, 0,000584794653074285 Pa·s a 293 K para su modelo ¹H/CDCl₃. No se debe confundir ese protocolo con una curva η(T) ni con una medición de la disolución.

13 · Diagnosticar convección antes de hablar de corrección

El flujo coherente puede producir fase y atenuación adicionales. Convección detectada, no detectable y no concluyente son estados distintos. «No detectable» no establece ausencia absoluta ni un límite de detección universal. Un R² alto tampoco descarta flujo.

Se comparan rampas de la misma preparación con tiempos de difusión compatibles, analito y referencias por separado, partes real e imaginaria cuando están disponibles, fase, residuos y dependencia de D aparente con d20. Distintos tiempos, temperaturas o preparaciones pueden introducir causas alternativas.

Una corrección física necesita codificación de movimiento/momentos de secuencia, modelo de ruido, controles, estabilidad y evidencia suficiente para separar difusión y flujo. Otra ruta usa una adquisición control sin convección de la misma preparación y condiciones revisadas. Son orígenes distintos: el informe debe indicar cuál se aplicó.

Sin control válido ni identificabilidad no existe un botón capaz de inventar D corregida. Se conserva el diagnóstico, se propone una adquisición adecuada y no se reescala el mapa entero por apariencia. Cambios durante una rampa también pueden sesgar la inversión, aunque no procedan de convección.

14 · Rh es una conversión hidrodinámica, no una regla geométrica universal

Para el modelo Stokes–Einstein apropiado:

\[R_h=\frac{k_BT}{6\pi\eta D}.\]

Se requieren T en kelvin, η en Pa·s y D en m²/s para obtener Rh en metros; 1 Å = 10⁻¹⁰ m. El radio es hidrodinámico efectivo: incorpora fricción, solvatación y forma bajo las hipótesis del modelo. No es automáticamente radio de giro, tamaño de una esfera rígida ni dimensión microscópica directa.

Una distribución permite calcular un promedio de Rh tras transformar cada bin; en general \(\langle R_h\rangle\neq k_BT/(6\pi\eta\langle D\rangle)\). La diferencia surge de promediar una función no lineal. Hay que declarar ponderación y soporte. Recuperar el Rh asumido del patrón después de calibrar con él es coherencia interna, no una medición independiente de ese Rh.

15 · MwOSY: calibración D→M dentro de un dominio

MwOSY transforma el eje de un resultado de difusión mediante una relación molecular documentada. Una ley de potencia típica se expresa con unidades de referencia explícitas:

\[\log_{10}(D/D_*)=a\log_{10}(M/M_*)+c.\]

\[M=M_*10^{[\log_{10}(D/D_*)-c]/a}.\]

Las curvas históricas PS y PPG de alta dilución son opciones diferentes. El modelo de concentración compartido fue desarrollado con PS; seleccionar PPG no crea otra ley de concentración validada. En su forma empírica utiliza:

\[D\eta(C)=D\eta(0)\exp[\kappa(M)C^{\nu}].\]

C es masa de soluto dividida por masa neta de disolvente, en mg/mg. Si title contiene primero soluto y después soluto + disolvente, se resta para obtener el disolvente. Ejemplo aritmético: 20 mg y 420 mg totales dan 400 mg de disolvente y C = 0,05, no 20/420 ni 5 mg/mL. Las pesadas sin unidades, ambiguas o ausentes no se convierten en cero.

Aquí κ(M) es el coeficiente con signo del código, negativo en las ramas históricas. La notación publicada con exp[−κ C^ν] y κ positivo es equivalente sólo si se cambia también esa convención; no se añade un segundo signo menos. Los coeficientes, ν y los tramos de κ(M) pertenecen al perfil; no se ajustan para reproducir una masa esperada ni se interpola a través de un hueco no representado por la ley. El modelo histórico conserva el cambio de tramo en 117 000 Da. La calibración familiar v2 usa D9 directamente y no debe confundirse con la ecuación histórica basada en Dη.

Disolvente, temperatura, concentración, familia, arquitectura, señal y referencia de masa delimitan la aplicación. Si faltan condiciones compatibles, conserve D en vez de forzar M. Las masas siguen siendo aparentes para estrellas, cepillos o resinas ramificadas sin evidencia específica; una referencia pequeña calibra D, no valida una relación molecular universal.

16 · Qué representa cada bin y cuándo aparece el Jacobiano

El contrato distingue amplitud integrada por bin, densidad por unidad lineal y densidad por unidad logarítmica. Deben constar variable, unidad, base del logaritmo, centros, límites, orientación, soporte, exclusiones y umbral. Una amplitud integrada no se multiplica otra vez por la anchura del bin.

Para un bin de límites positivos L y U, amplitud a y logaritmo base 10:

\[\rho_{\rm lin}=a/(U-L),\qquad \rho_{\log}=a/\log_{10}(U/L).\]

Al transformar D→M se transforma todo el eje y sus límites, se conserva el peso integrado de cada celda y se reordena correctamente si la calibración invierte la orientación. El Jacobiano corresponde a una densidad:

\[\rho_M(M)=\rho_D(D(M))\left|\frac{dD}{dM}\right|.\]

Para una ley \(D\propto M^a\), las densidades por logaritmos de la misma base cumplen \(\rho_{\log M}=|a|\rho_{\log D}\) en posiciones correspondientes. La amplitud integrada permanece igual. Cambiar la base logarítmica también exige su factor, no sólo renombrar el eje.

Los invariantes comprobables son conservación de amplitud y equivalencia entre representaciones D y M ascendentes/descendentes. Se conserva el resumen histórico con su umbral —por ejemplo, 1 %— separado del soporte completo del laboratorio, 0 %. El umbral visual del mapa es otro criterio y no debe recortar los momentos científicos.

17 · Mn, Mw y dispersidad necesitan declarar la ponderación

Con fracciones numéricas normalizadas \(n_i\):

\[\begin{aligned}M_n&=\sum_i n_iM_i,\\M_w&=\frac{\sum_i n_iM_i^2}{\sum_i n_iM_i}.\end{aligned}\]

Con fracciones másicas normalizadas \(w_i\):

\[\begin{aligned}M_n&=\left(\sum_i w_i/M_i\right)^{-1},\\M_w&=\sum_i w_iM_i.\end{aligned}\]

En ambos casos \(\mathit{Đ}=M_w/M_n\), sólo cuando el contrato y el dominio permiten esa interpretación. Si la respuesta RMN por especie es desconocida, las amplitudes no se convierten automáticamente en fracciones numéricas o másicas: Mn, Mw y dispersidad molecular permanecen no disponibles. Una hipótesis de respuesta másica produce descriptores aparentes condicionados, no momentos absolutos validados.

La masa obtenida de D media, \(M(\langle D\rangle)\), no es Mn ni Mw; la masa del máximo es otra magnitud. Lo mismo ocurre con D modal, D monoexponencial y promedio de una distribución. Se comunican etiquetas separadas, soporte y ponderación. Las áreas gaussianas visuales no sustituyen los pesos del contrato.

18 · Presupuesto de incertidumbre y estabilidad no son sinónimos

El presupuesto reúne fuentes documentadas: ajuste, gradiente, patrón, temperatura, viscosidad y calibración molecular. Una celda vacía significa desconocido, no cero. Los errores de escala comunes no disminuyen simplemente por sumar bins o señales. Las covarianzas importan, por ejemplo, cuando T se usa a la vez en D esperada, corrección y Rh.

En una aproximación de primer orden, con jacobiano J y covarianza de entradas Σ:

\[\Sigma_{\rm out}\approx J\Sigma_{\rm in}J^{\mathsf T}.\]

El Monte Carlo correlacionado propaga entradas coherentes y permite relaciones no lineales bajo el modelo declarado. Se separa incertidumbre de escala, variación de forma y sesgo de modelo. Un intervalo no cubre automáticamente sesgos desconocidos de secuencia, flujo, arquitectura o viscosidad.

Para un intervalo del procedimiento completo habría que repetir preprocesado dependiente de los datos, inversión y selección de regularización/modelo en cada remuestreo apropiado. Si esas decisiones quedan fijas, el intervalo se etiqueta condicionado. Datos heterogéneos, correlacionados y agrupados no justifican por defecto un bootstrap iid de residuos.

La estabilidad examina sensibilidad a rejilla, regularización y perturbaciones: no es por sí misma un intervalo de confianza. La cobertura sólo se evalúa con simulaciones independientes o controles apropiados, indicando número de ensayos y error estadístico. Los documentos JCGM/GUM y su suplemento Monte Carlo fundamentan la propagación, no validan automáticamente el modelo físico de la muestra.

19 · Calibrar por familia sin aprender del conjunto de validación

El perfil familiar versionado conserva ecuación literal, unidades, familia y arquitectura, disolvente, T, concentración, señal, instrumento, método de masa de referencia, dominio y procedencia. El modelo v2 utiliza \(\log_{10}(D_9)=a\log_{10}(M_{\rm Da})+c\), con \(D_9=D/(10^{-9}\,{\rm m^2/s})\). Sus coeficientes no se mezclan con los de una ecuación Dη.

El ajuste contempla incertidumbres en D y en las masas de referencia, covarianza de parámetros y fuentes compartidas mediante una adaptación propia de errores en variables. Con x = log₁₀(M), y = log₁₀(D9) y r = y − ax − c, la covarianza del residuo depende de la pendiente:

\[V(a)=C_{yy}+a^2C_{xx}-a(C_{xy}+C_{yx}).\]

\[Q=r^{\mathsf T}V(a)^{-1}r.\]

No se anuncia como paridad con York u ODRPACK. La aproximación logarítmica de primer orden tiene guardas de incertidumbre relativa; la covarianza local de parámetros no se convierte en validación externa. La partición por preparación o lote se fija antes de ajustar; la validación reservada y externa no cambia los coeficientes.

Se exportan errores de validación, ecuación, condiciones e incertidumbre. Cambios de unidades deben transformar interceptos y dominios de forma coherente. Una familia, arquitectura o condición incompatible y una extrapolación fuera del dominio bloquean la aplicación. Un perfil nuevo crea una revisión derivada; no reescribe calibraciones históricas.

La integración permite revisión local y del mapa completo con aplicación explícita. Los fixtures sintéticos verifican contratos y cálculos; no constituyen una nueva serie de patrones familiares reales. SEC/GPC u otra referencia ortogonal conserva su calibración, limitaciones y objetivo molecular, no se trata como verdad sin incertidumbre.

20 · Solapamientos: separar señal no es recuperar concentración sin hipótesis

Una señal superpuesta puede contener contribuciones con D diferentes, pero sus amplitudes observadas dependen también de protones equivalentes, respuesta, relajación, excitación y procesado. El componente dominante en un algoritmo no tiene por qué ser el más concentrado. Dos especies con D casi indistinguibles pueden ser no identificables a partir de esa atenuación.

Los ajustes anclados y pilotos conjuntos conservan la relación por adquisición:

\[A_{\rm obs}=\sum_c A_{c,\rm pred}+A_{\rm residual,signed}.\]

No se elimina un residuo negativo para imponer una suma falsa. Se revisan anclas, señales acompañantes, recuperación minoritaria, falsos componentes y predicción reservada. NMF o una factorización no negativa no garantizan una solución química única; sus factores pueden tener ambigüedad de escala y orden.

La cuantificación qNMR necesita integrales comparables, número de protones, cantidad nominal y pureza del patrón y adquisición cuantitativa revisada. En el caso ideal, \(n_x=n_{s,\rm nominal}p_s(A_x/N_x)/(A_s/N_s)\), con correcciones y unidades documentadas. La pureza p se aplica una vez: no se usa una cantidad ya corregida como si fuera nominal. Volumen y composición son necesarios para convertir a concentración. Este cálculo de cantidad no incluye por sí mismo un presupuesto de incertidumbre. Retraso de relajación, saturación, línea base y solapamiento no desaparecen por usar un patrón. Véase Pauli y colaboradores, 2012.

21 · SPEN y ultrafast: el observable decide el kernel

La codificación espacial puede almacenar información de difusión en una sola adquisición o en esquemas rápidos, pero necesita modelo espacial, forma de chirp, gradientes, perfil de bobina y orden de lectura. Un mapa espacial no se convierte automáticamente en DOSY ppm–D aplicándole b convencional.

• SPEN-DOSY/EPSI: contrato de codificación y lectura espacial, eje, fase, perfil medido y kernel revisados. Los ejemplos publicados conservan DOI, repositorio, licencia y hashes; una reproducción con herramientas de autores se identifica como externa.
• Ultrafast CPMG D–T₂: el eje de ecos conserva tiempo, no desplazamiento químico. El modelo separable ideal usa un kernel de difusión y otro de relajación; T₂ es efectivo y puede incluir difusión durante lectura u otros efectos.
• TRAIn2D y FISTA 2D: métodos distintos. La adaptación propia TRAIn2D utiliza su criterio respecto al residuo NNLS; FISTA usa regularización y criterio KKT. Un fallo no se sustituye silenciosamente por otro método.

\[Y\approx K_DXK_{T_2}^{\mathsf T},\qquad (K_{T_2})_{j\ell}=e^{-t_j/T_{2,\ell}}.\]

El ejemplo local Marek 1502 permite estudiar el procesado del cuaderno y los contratos; tiene NS = 16, no se anuncia como single-scan. Su perfil uniforme supuesto y escala exploratoria no validan D cuantitativa, MwOSY ni una secuencia nueva. Los datos privados no se redistribuyen aquí.

El recorrido guiado exige controles contra DOSY convencional de la misma preparación, tolerancias predeclaradas, residuos y bordes. La literatura SPEN muestra dependencias de SNR y separación en D; no demuestra que SCORE o cualquier método resuelvan toda mezcla. Consulte Lorandel y colaboradores, 2025, y los ejemplos enlazados desde Prime.

22 · Comparar muestras y seguir cinéticas sin confundir causas

Cada adquisición debe registrar concentración, T, disolvente, aditivos, patrones, duración y orden. Primero se comparan D medida del analito y referencias, después factores y D corregida. Una dependencia residual con concentración o tiempo indica revisión del modelo; no identifica automáticamente agregación, crecimiento molecular o curado.

Las preparaciones independientes se distinguen de rampas repetidas. Las referencias ortogonales SEC/GPC u otras incorporan su calibración y limitaciones. Se compara el mismo objetivo: una media de respuesta espectral no se confronta como si fuera necesariamente Mn absoluto de otra técnica.

Una muestra que evoluciona durante su propia rampa rompe la hipótesis de señal estacionaria. El módulo de cinética conserva avisos intrarrampa y tasas aparentes cuando corresponde. La concordancia de controles, la invariancia respecto al orden y el análisis de residuos ayudan a decidir el siguiente experimento; no sustituyen un diseño experimental independiente.

23 · Un benchmark reproducible, no un concurso de curvas bonitas

La comparación compartida incluye inicialmente monoexponencial, TRAIn, NNLS, Tikhonov y MaxEnt. Desarrollo, selección y TEST se separan por preparación; casos, parámetros y criterios se congelan antes de abrir TEST. La inclusión de otro método exige implementación, licencia, entorno y entradas verificables.

Se prueban señal nula, monoexponenciales, mezclas, minoritarios, distribuciones anchas, solapamientos, ruido correlacionado, deriva, réplicas, trenes cortos y componentes fuera del soporte. Se miden sesgo D, predicción reservada, amplitud minoritaria, falsos componentes, cobertura condicionada, censura, tiempo y memoria.

La distancia Wasserstein se calcula en una coordenada común declarada —por ejemplo, log₁₀(D)— tras normalizar la forma; el error de amplitud total se informa aparte. Cambiar de D a log D cambia la métrica. Ampliar la malla no demuestra que una componente exterior sea identificable.

NMRInversions, DRECT, DREAM u otros comparadores externos sólo aportan resultados si han sido ejecutados con su entorno y procedencia verificados. Un adaptador o una casilla no equivalen a una ejecución. Se registran fallos, versiones y métodos no disponibles sin promocionarlos como validados.

24 · Desarrollos experimentales: qué se investiga y qué no se promete

Una implementación inspirada en un trabajo publicado se rotula como propia; no se atribuye paridad con DRECT, DREAM o STELT sin código, pesos, dominio y reproducción verificables. Estos pilotos conservan revisiones independientes y no sustituyen mapas aceptados.

25 · Beatrix acompaña la revisión; no inventa hechos numéricos

Beatrix utiliza la selección visible, hechos calculados y documentación para explicar avisos y proponer comprobaciones durante el flujo. Hover, selección y consulta deben mantener el mismo contexto; una tarjeta histórica no se aplica a otra rampa. Las coincidencias documentales son hipótesis, no probabilidades de identidad.

Las tablas de Gottlieb, Kotlyar y Nudelman y Fulmer y colaboradores orientan la revisión de disolventes e impurezas. La compatibilidad de un desplazamiento depende del núcleo, medio y condiciones; una coincidencia ppm aislada no confirma ftalatos, patrón interno ni otra especie. Busque señales acompañantes, multiplicidad y evidencia de la misma preparación.

En Prime pueden configurarse reglas locales, modelos GGUF CPU o un servidor/API compatible. Tamaño del modelo, RAM, CPU y servicio disponible condicionan recursos y rapidez. Una GPU se usa sólo cuando el servidor configurado la ofrece; elegir «grande» no descarga un modelo ni activa una GPU automáticamente. En ResinAtOnce, los perfiles locales Ligero/Avanzado son presupuestos CPU del asistente incluido, no la misma conexión API de Prime.

La inferencia local exige modelo/corpus/manifiesto compatibles y controles de integridad. Si falla, la guía por reglas sigue disponible y se identifica como tal. Un proveedor remoto requiere HTTPS, configuración y permiso explícito para enviar contexto. Claves, identidades protegidas y credenciales no pertenecen al proyecto ni al informe científico.

Ejemplos de preguntas útiles: «¿Qué falta revisar en esta rampa?», «¿Por qué no converge este método?», «¿Estoy comparando una señal local con una banda global?» o «¿Qué evidencia acompañante necesito para esta hipótesis?». COSY/HSQC/HMBC realmente observados de la misma preparación pueden apoyar la revisión. Beatrix no transforma un fragmento compatible en especie confirmada ni modifica calibraciones para cumplir una expectativa.

26 · Guardar, reproducir y comunicar la revisión correcta

La trazabilidad reúne originales y su huella, muestra, secuencia, núcleo, gradientes y tiempos, TE, pesadas, procesado, ruido, calibración, solver, parámetros, distribución y estados. La caché depende de entradas, protocolo y motor; un cambio o corrupción invalida la recuperación. Recuperar un cálculo completo no significa reanudar una iteración interna.

Los paquetes versionados permiten intercambio y replay desde atenuaciones conservadas y, en el recorrido compatible, extracción desde originales procesados incluidos. No se anuncia reprocesado FID universal. Cada derivada conserva relación con su origen; aceptar y aplicar una revisión son acciones explícitas distintas de simplemente verla.

«Resultado y edición no coinciden» indica que lo guardado pertenece a otras condiciones. Se recupera su configuración o se calcula una revisión nueva, sin renombrar un resultado anterior como si fuera nuevo. Cancelar mantiene los resultados completos previos y el estado del intento; no convierte un archivo parcial en resultado aceptado.

Las salidas compatibles incluyen proyecto y contratos JSON, tablas CSV, informe HTML/DOCX y figuras. PNG de alta resolución conserva vista, zoom, tema y etiquetas; 4800 píxeles/300 ppp es una propuesta de presentación, no más resolución científica. Una imagen no sustituye datos ni manifiestos. Consulte la exportación Prime y la exportación ResinAtOnce.

27 · Ejemplo trabajado: misma señal, distintas preguntas

Ejemplo exclusivamente sintético y aritmético. No corresponde a una muestra, patrón o calibración validados. Suponga D medida = 0,500 × 10⁻⁹ m²/s, factor de patrón 0,900, T adquirida 295 K y normalización lineal a 293 K.

\[f_T=293/295,\quad f_{\rm total}=0.900(293/295).\]

\[D_{\rm final}=0.446949\times10^{-9}\;{\rm m^2/s}.\]

Ese producto se aplica una vez a todos los centros y límites D de su distribución; no vuelve a multiplicarse al exportar o convertir a M. Rh necesita además η y el estado térmico coherente. La cifra central no informa por sí sola de anchura, componentes ni masa molecular.

Considere ahora una calibración sintética \(M=10\,000/D_9^2\) y dos bins D9 = 1 y 0,5 con amplitudes integradas iguales. Sus masas son 10 000 y 40 000 Da. El peso de cada bin sigue siendo 0,5 tras transformar el eje:

En cambio, transformar D9 media = 0,75 da M(D media) ≈ 17 777,8 Da: no es ninguno de los momentos anteriores. Ésta es la razón práctica para conservar etiquetas, ponderación, unidades y soporte en pantalla, proyecto e informe.

28 · Qué significa que una función esté disponible

Se distinguen cinco controles: ejecución —el proceso terminó—; convergencia —cumplió un criterio numérico—; compatibilidad con ruido —el modelo y el ruido declarado explican los datos según el test—; identificabilidad —los datos distinguen la magnitud o componentes pretendidos—; y validación experimental —controles independientes respaldan el uso físico en ese dominio—. Ninguno implica automáticamente el siguiente.

Lista final antes de comunicar

1. Identifique preparación, rampa, región, rol de señal y resultado realmente guardado.
2. Compruebe b, unidades, secuencia, calibración, factores por bloque y aplicación única al eje.
3. Revise atenuación/predicción, residuos, correlación, soporte y señal censurada en los extremos.
4. Declare medida, ponderación, umbral, D modal/media/monoexponencial, Rh y momentos disponibles.
5. Indique dominio molecular, concentración, incertidumbre y lo que permanece desconocido o no convergido.
6. Conserve revisión anterior, manifiestos y entradas autorizadas; abra el informe exportado y compruebe sus cifras y etiquetas.

Si aparece un error, conserve mensaje, versión, método y pasos y consulte las FAQ o soporte. No borre contratos ni modifique hashes para silenciar una verificación. Registro de instalación, cuenta de investigador y solicitud de soporte son procesos diferentes.

Referencias científicas, implementaciones y lectura ampliada

Las fuentes fundamentan métodos y límites; no certifican automáticamente la implementación ni una muestra. Los artículos del proyecto, DOI y ejemplos con procedencia se reúnen en Publicaciones y Fuentes de Prime. Las adaptaciones propias —incluidos iCOshift-Prime, el port TRAIn-MF, MaxEnt del laboratorio y los pilotos— conservan esa condición.

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2. Holz, M.; Heil, S. R.; Sacco, A. (2000). Temperature-dependent self-diffusion coefficients of water and six selected molecular liquids for calibration in accurate ¹H NMR PFG measurements. PCCP 2, 4740–4742. 10.1039/B005319H. Calibración de difusión y dependencia térmica.
3. Lawson, C. L.; Hanson, R. J. (1974; edición SIAM 1995). Solving Least Squares Problems. 10.1137/1.9781611971217. Fundamentos NNLS, no identificación química.
4. Day, I. J. (2011). On the inversion of diffusion NMR data: Tikhonov regularization and optimal choice of the regularization parameter. JMR 211, 178–185. 10.1016/j.jmr.2011.05.014. Regularización y selección de parámetros.
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